More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0638 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 345 aa  691    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  79.94 
 
 		 345 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  78.84 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  78.36 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  73.84 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  51.26 
 
 		 442 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  48.77 
 
 		 502 aa  334  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  49.38 
 
 		 491 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  48.77 
 
 		 490 aa  320  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  47.53 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  45.32 
 
 		 522 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.98 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  45.81 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  45.57 
 
 		 505 aa  290  2e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  39.89 
 
 		 514 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  40.3 
 
 		 514 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  41.52 
 
 		 514 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  47.97 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  40.85 
 
 		 514 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  40.61 
 
 		 514 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  44.91 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  40.84 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  44.07 
 
 		 406 aa  263  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  40.41 
 
 		 382 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  44.18 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  46.34 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  39.64 
 
 		 393 aa  255  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  41.96 
 
 		 505 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.96 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  41.67 
 
 		 505 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  35.94 
 
 		 492 aa  253  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  40.43 
 
 		 460 aa  252  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 520 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  43.53 
 
 		 525 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  41.02 
 
 		 503 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  41.07 
 
 		 505 aa  250  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  41.04 
 
 		 509 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  41.33 
 
 		 505 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  43.56 
 
 		 520 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.95 
 
 		 508 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  41.82 
 
 		 555 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  42.82 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  43.87 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  36.23 
 
 		 492 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  36.23 
 
 		 492 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  39.69 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  35.65 
 
 		 492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  39.47 
 
 		 485 aa  245  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  42.02 
 
 		 521 aa  245  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  42.63 
 
 		 521 aa  245  9e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  40.82 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  38.34 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  40.67 
 
 		 387 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  39.45 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  39.47 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  43.86 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  39.76 
 
 		 386 aa  242  6e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  43.73 
 
 		 520 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2127  trans-homoaconitate synthase  38.2 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.70661 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  42.26 
 
 		 532 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  42.59 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  41.8 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  39.23 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  38.89 
 
 		 504 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  40.32 
 
 		 387 aa  239  4e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  39.51 
 
 		 500 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  42.94 
 
 		 519 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  40.36 
 
 		 514 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  41.72 
 
 		 526 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1099  trans-homoaconitate synthase  39.57 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  39.49 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  39.14 
 
 		 512 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  40.51 
 
 		 514 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  38.51 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  39.55 
 
 		 516 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  39.63 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1776  trans-homoaconitate synthase  39.51 
 
 		 377 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0938  trans-homoaconitate synthase  39.75 
 
 		 378 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  40.9 
 
 		 507 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  40.17 
 
 		 522 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  40.06 
 
 		 515 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  39.04 
 
 		 525 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  40.6 
 
 		 509 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  39.62 
 
 		 524 aa  236  6e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 556 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3956  trans-homoaconitate synthase  39.44 
 
 		 377 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000442748  hitchhiker  0.00302646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2141  2-isopropylmalate synthase  41.59 
 
 		 519 aa  235  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.720274  normal  0.0787269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  39.82 
 
 		 507 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1804  trans-homoaconitate synthase  39.21 
 
 		 377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.248847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  39.81 
 
 		 503 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  39.17 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  42.49 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0598  trans-homoaconitate synthase  37.84 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.961177  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  38.96 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  39.55 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  38.34 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0859  2-isopropylmalate synthase  40.56 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  38.1 
 
 		 514 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  39.58 
 
 		 556 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>