More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4344 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 337 aa  681    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  67.67 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  43.82 
 
 		 350 aa  287  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 352 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  43.53 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  43.53 
 
 		 354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 350 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  43.49 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  42.01 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  42.15 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  39.32 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  42.48 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  40.36 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  38.76 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  38.12 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  37.24 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  36.9 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 431 aa  246  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  39.45 
 
 		 339 aa  241  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  35.63 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  39.14 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  36.53 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  38.05 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  38.23 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  35.91 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  45.62 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  39.33 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  37.74 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.11 
 
 		 352 aa  232  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.33 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  36.5 
 
 		 342 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2695  uroporphyrinogen decarboxylase  38.04 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  35.99 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  40.66 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  37.01 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  38.26 
 
 		 361 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  38.76 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  40.43 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  34.32 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  38.26 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  36.72 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  36.42 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  39.09 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  37.97 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  36.23 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  39.76 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  36.01 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  35.67 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  36.23 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  37.9 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  35.39 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  35.52 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  35.93 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  37.01 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  37.01 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  37.71 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  38.75 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  34.21 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2843  uroporphyrinogen decarboxylase  39.29 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  39.25 
 
 		 360 aa  215  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  36.72 
 
 		 354 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  36.83 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  36.72 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  36.72 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00030  uroporphyrinogen decarboxylase, putative  37.01 
 
 		 380 aa  214  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000569927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 345 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1200  uroporphyrinogen decarboxylase  35 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  37.01 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  37.28 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  38.37 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  36.72 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  36.19 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  36.98 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  37.31 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  37.13 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  36.83 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  35.93 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  40.49 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  35.82 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  35.33 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>