76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3603 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 453 aa  928    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  34.34 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  30.54 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  31.4 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  29.18 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  28.35 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  23.96 
 
 		 438 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.91 
 
 		 947 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  23.49 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  25.52 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  22.38 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.29 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  30.86 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.95 
 
 		 528 aa  74.3  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.86 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  24.5 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28.21 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.3 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  27.68 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  23.71 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  26.22 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.18 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.67 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  26.72 
 
 		 495 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.71 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.16 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  23.69 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  20.69 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  34.95 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  24.69 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  31.78 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  33.59 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  23.25 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  31.03 
 
 		 596 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  21.31 
 
 		 432 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  32.03 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  35.37 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  23.48 
 
 		 414 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  22.36 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  23.23 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  23.23 
 
 		 439 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.56 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  27.05 
 
 		 979 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  36.47 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  20.74 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  21.69 
 
 		 313 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  22.69 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  27.12 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  36.9 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  36.62 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  23.63 
 
 		 366 aa  47.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  20.25 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  36.67 
 
 		 960 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  35.82 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  21.86 
 
 		 450 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  29.23 
 
 		 877 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  35.24 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  48.65 
 
 		 961 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.59 
 
 		 739 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  21.72 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  51.35 
 
 		 933 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  51.35 
 
 		 848 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  51.35 
 
 		 968 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  45.24 
 
 		 968 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  32.91 
 
 		 878 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  28.04 
 
 		 610 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.29 
 
 		 372 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  29.41 
 
 		 540 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  44.74 
 
 		 937 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.37 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  48.65 
 
 		 933 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  48.65 
 
 		 906 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.84 
 
 		 733 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 259 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  32.39 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>