More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1092 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1092  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
434 aa  863    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.629609  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  36.63 
 
 
413 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0792  Extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
400 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1904  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 
400 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  27.88 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  26.13 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 
416 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  26.47 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0641  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
418 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.1 
 
 
401 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1502  extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
418 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23648  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
406 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  25.77 
 
 
414 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.61 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 
416 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.51 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3400  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  24.61 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  24.4 
 
 
408 aa  86.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  24.17 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  25.7 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3748  Extracellular ligand-binding receptor  24.29 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.47 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1782  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.47 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1118  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000205251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2279  extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2827  extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.11004  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  26.57 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1117  extracellular ligand-binding receptor  23.56 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000089327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2807  putative periplasmic substrate-binding protein  24.37 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1539  Extracellular ligand-binding receptor  23.16 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1136  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.206863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  22.92 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2747  putative periplasmic substrate-binding protein  24.09 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.87 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0572  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.09 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2846  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.09 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.87 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1756  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.09 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0548138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2434  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.09 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00891241  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  24.47 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.25 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1761  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.78 
 
 
467 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  24.7 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2866  periplasmic ligand binding lipoprotein  23.64 
 
 
662 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.691628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.45 
 
 
515 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  21.14 
 
 
401 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  23.39 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  21.87 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.01 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.01 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1598  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1141  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 
382 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  21.11 
 
 
394 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  21.93 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0686  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1165  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 
461 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.439455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 
375 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.76 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  23.55 
 
 
397 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  23.36 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5995  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.814001  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1661  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.21 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00010868  normal  0.0729717 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
394 aa  61.6  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  21.6 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.13 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.01 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  21.6 
 
 
383 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  23.27 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.87 
 
 
405 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.91 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
382 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  23.28 
 
 
383 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4008  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
373 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.746913  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4359  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
373 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3058  extracellular ligand-binding receptor  22.64 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5309  extracellular ligand-binding receptor  22.64 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.186665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>