More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2869 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  100 
 
 		 452 aa  937    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  72.57 
 
 		 449 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  72.22 
 
 		 468 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2467  bifunctional hypothetical protein/integrase  68.56 
 
 		 457 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2576  integron integrase  66.23 
 
 		 453 aa  621  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  45.86 
 
 		 338 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  44.13 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1215  integron integrase  44.17 
 
 		 326 aa  270  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  42.07 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0779  integron integrase  42.41 
 
 		 320 aa  257  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000312296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  42.04 
 
 		 334 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  43.63 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  43.63 
 
 		 332 aa  254  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  42.36 
 
 		 334 aa  253  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0542  integrase  41.27 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3427  integron integrase  41.4 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  43.63 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1377  site-specific recombinase XerD  39.68 
 
 		 333 aa  240  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000056918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0696  phage integrase  44.13 
 
 		 338 aa  239  8e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  41.08 
 
 		 337 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  40.76 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  40.76 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  40.76 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  40 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  42.33 
 
 		 319 aa  222  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  41.85 
 
 		 319 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  42 
 
 		 319 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2645  integron integrase  40.67 
 
 		 319 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  41.85 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  42.49 
 
 		 318 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  37.58 
 
 		 327 aa  219  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  41.53 
 
 		 319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  40.58 
 
 		 320 aa  216  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  41.21 
 
 		 319 aa  216  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  39.49 
 
 		 320 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  38.83 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  40.6 
 
 		 319 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4396  integron integrase  40.97 
 
 		 318 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  0.0224938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1393  integron integrase  39.37 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.597371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  36.1 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0425  XerC/CodV family integrase/recombinase  37.58 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4307  integron integrase  39.3 
 
 		 319 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  36.91 
 
 		 322 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03940  site-specific recombinase  42.59 
 
 		 291 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.781769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  39.7 
 
 		 276 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1633  phage integrase family site specific recombinase  38.2 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180477  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0840  integron integrase  38.05 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623931  hitchhiker  0.00150822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3075  integron integrase  40.28 
 
 		 232 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1843  integron integrase  33.98 
 
 		 279 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  33.22 
 
 		 291 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  41.48 
 
 		 694 aa  139  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2872  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 279 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000984905  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  43.33 
 
 		 159 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  32.69 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  31.87 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  31.68 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  31.68 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  31.35 
 
 		 302 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.38 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  32.23 
 
 		 270 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 301 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  30.89 
 
 		 289 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4142  integron integrase  41.55 
 
 		 156 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.18 
 
 		 290 aa  113  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 290 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  29.45 
 
 		 291 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  30.48 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  30.38 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  28.03 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  28.44 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.39 
 
 		 292 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.39 
 
 		 292 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.39 
 
 		 292 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  30.49 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  32.28 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  30.79 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  31.31 
 
 		 286 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.37 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 283 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  27.3 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  31.11 
 
 		 291 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  30.72 
 
 		 304 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  31.11 
 
 		 291 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.85 
 
 		 316 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  27.71 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  29.22 
 
 		 287 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  29.22 
 
 		 287 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4832  phage integrase  28.62 
 
 		 291 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  29.22 
 
 		 287 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  29.22 
 
 		 287 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2164  phage integrase family site specific recombinase  29.22 
 
 		 287 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2211  phage integrase family site specific recombinase  29.22 
 
 		 287 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.82 
 
 		 301 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.08 
 
 		 307 aa  98.2  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.86 
 
 		 299 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.86 
 
 		 299 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>