251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1407 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  76.89 
 
 		 900 aa  1187    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  69.62 
 
 		 897 aa  1111    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 859 aa  1672    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  74.82 
 
 		 992 aa  1058    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  69.62 
 
 		 1000 aa  916    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  42.37 
 
 		 934 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  43.07 
 
 		 829 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  47.25 
 
 		 675 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  34.98 
 
 		 1309 aa  395  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  35.76 
 
 		 1324 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  36.01 
 
 		 845 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  37.27 
 
 		 899 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  35.99 
 
 		 911 aa  372  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  36.5 
 
 		 838 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  34.71 
 
 		 1500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 		 785 aa  358  2.9999999999999997e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1383 aa  356  8.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  34.54 
 
 		 843 aa  347  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 1314 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  34.98 
 
 		 1068 aa  344  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  34.06 
 
 		 963 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  34.83 
 
 		 1056 aa  325  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  35.54 
 
 		 849 aa  320  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1523 aa  294  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  34.73 
 
 		 1509 aa  287  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  32.4 
 
 		 1311 aa  257  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  35.65 
 
 		 686 aa  244  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  61.35 
 
 		 234 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1039 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1010 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  38.44 
 
 		 385 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  30.01 
 
 		 793 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  30.5 
 
 		 1326 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.25 
 
 		 801 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1088 aa  188  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  31.47 
 
 		 713 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.42 
 
 		 1424 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1050 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  28.53 
 
 		 1261 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  43.55 
 
 		 373 aa  171  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 		 1262 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 		 1146 aa  161  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1283 aa  161  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.65 
 
 		 1288 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  26.98 
 
 		 1128 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 		 1185 aa  153  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.96 
 
 		 1125 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1105 aa  141  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.4 
 
 		 828 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 857 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  31.78 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 814 aa  134  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 850 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 		 1136 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 953 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 924 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.21 
 
 		 1131 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  48.52 
 
 		 358 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 837 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1209  hypothetical protein  67.5 
 
 		 110 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  33.33 
 
 		 715 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 640 aa  106  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  27.31 
 
 		 1468 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 966 aa  105  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.07 
 
 		 841 aa  104  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1404 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 776 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  39.33 
 
 		 266 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  29.17 
 
 		 1488 aa  99.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1212 aa  99.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 1186 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  40.46 
 
 		 1355 aa  97.8  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  45.21 
 
 		 405 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 751 aa  96.3  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  40.35 
 
 		 540 aa  95.5  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  29.63 
 
 		 847 aa  95.1  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  37.14 
 
 		 157 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  43.66 
 
 		 161 aa  94  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  37.2 
 
 		 237 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  37.23 
 
 		 235 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 843 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  27.5 
 
 		 958 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  36.88 
 
 		 238 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  35.63 
 
 		 374 aa  88.6  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  36.91 
 
 		 705 aa  87.8  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 652 aa  85.9  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  37.8 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1017 aa  85.1  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  33.33 
 
 		 1901 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 671 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  33.48 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  28.52 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.1 
 
 		 2145 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  30.03 
 
 		 1003 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  25.31 
 
 		 965 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  35.66 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 		 526 aa  77.4  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  28.45 
 
 		 633 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>