77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0250 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  78.9 
 
 		 464 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0195  TraG family protein  98.03 
 
 		 457 aa  925    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0250  TraG family protein  100 
 
 		 457 aa  943    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  56.75 
 
 		 470 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  42.11 
 
 		 455 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  26.19 
 
 		 659 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  25.95 
 
 		 644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0632  hypothetical protein  26.14 
 
 		 708 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3937  hypothetical protein  23.81 
 
 		 664 aa  99.8  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.280709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  22.9 
 
 		 706 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2764  hypothetical protein  23.91 
 
 		 752 aa  96.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3012  hypothetical protein  24.53 
 
 		 701 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4179  putative plasmid transfer protein  24.82 
 
 		 704 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4096  putative plasmid transfer protein  24.82 
 
 		 730 aa  94  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0066  type IV conjugative transfer system protein TraD  22.2 
 
 		 621 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0326  putative plasmid transfer protein  23.35 
 
 		 704 aa  93.6  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  22.06 
 
 		 703 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2934  hypothetical protein  24.58 
 
 		 708 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0527  hypothetical protein  23.36 
 
 		 730 aa  90.5  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  23.54 
 
 		 719 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3305  hypothetical protein  24.4 
 
 		 707 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.705232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2336  hypothetical protein  23.3 
 
 		 729 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000037751  unclonable  0.000000407207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  22.84 
 
 		 743 aa  88.2  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2380  hypothetical protein  23.36 
 
 		 718 aa  87.8  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.248119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4169  hypothetical protein  22.82 
 
 		 727 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1454  hypothetical protein  23.54 
 
 		 719 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  23.06 
 
 		 733 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1195  hypothetical protein  22.87 
 
 		 728 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1274  hypothetical protein  22.82 
 
 		 730 aa  86.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1408  hypothetical protein  22.82 
 
 		 730 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.950579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0963  hypothetical protein  22.87 
 
 		 718 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  22.87 
 
 		 718 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2845  hypothetical protein  23.11 
 
 		 721 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  23.11 
 
 		 719 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  21.99 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.22 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2398  hypothetical protein  40.19 
 
 		 668 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4266  hypothetical protein  21.08 
 
 		 629 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2598  hypothetical protein  21.53 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.887082  normal  0.897508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  22.9 
 
 		 619 aa  73.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2307  hypothetical protein  21.34 
 
 		 635 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  21.97 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1549  hypothetical protein  21.16 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167533  normal  0.131321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3750  hypothetical protein  21.45 
 
 		 635 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4501  TraG/TraD family protein  21.43 
 
 		 743 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6502  hypothetical protein  21.45 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571397  normal  0.732963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0906  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  20.86 
 
 		 765 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59690  hypothetical protein  21.13 
 
 		 744 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000194089  decreased coverage  4.4297400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6729  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  23.22 
 
 		 830 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577691  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5613  hypothetical protein  21.87 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  21.27 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  21.27 
 
 		 618 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3629  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1276 aa  55.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1026  hypothetical protein  21.19 
 
 		 657 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2815  type IV conjugative transfer system protein TraD  24.81 
 
 		 615 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  32.35 
 
 		 792 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  34.38 
 
 		 783 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  34.38 
 
 		 783 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  32.35 
 
 		 792 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  29.17 
 
 		 952 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2068  hypothetical protein  24.15 
 
 		 728 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000291289  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6309  hypothetical protein  20.31 
 
 		 622 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.800389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2184  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  20 
 
 		 798 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  34.29 
 
 		 934 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1553  conserved hypothetical protein  22.06 
 
 		 998 aa  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6850  type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  32.91 
 
 		 833 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0108098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5224  hypothetical protein  31.33 
 
 		 650 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2425  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  21.97 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2031  hypothetical protein  30.59 
 
 		 205 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4079  hypothetical protein  34.25 
 
 		 876 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00459285  normal  0.104503 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1694  Type IV secretory pathway VirD4 components-like  39.29 
 
 		 832 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000925009  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2549  hypothetical protein  39.29 
 
 		 832 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4741  hypothetical protein  32.69 
 
 		 629 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.404612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2745  Type IV secretory pathway VirD4 protein-like protein  37.5 
 
 		 841 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  34.33 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4680  protein of unknown function DUF853, NPT hydrolase putative  46 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1346  hypothetical protein  37.31 
 
 		 859 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>