106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2276 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 271 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  98.89 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  71.92 
 
 		 267 aa  348  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  65.04 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  63.6 
 
 		 285 aa  321  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  59.85 
 
 		 264 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  62.13 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  59.77 
 
 		 288 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 271 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  56.83 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  58.27 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  54.89 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  55.68 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  59.25 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 264 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  51.91 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  59.34 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  52.14 
 
 		 262 aa  252  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  52.51 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  53.28 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  52.5 
 
 		 273 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  50.38 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  52.16 
 
 		 270 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  54.19 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  46.48 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  46.48 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  47.15 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  45.56 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 287 aa  205  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  47.3 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 254 aa  185  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  46.22 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  38.22 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  37.4 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  42.28 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  37.77 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  37.91 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.64 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 106 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1326  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.64 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  37.93 
 
 		 149 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 145 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 131 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 131 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 91 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0020  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 70 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.555038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 84 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  37.93 
 
 		 75 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  29.45 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 48 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 73 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  36.21 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  36.21 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1737  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 493 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.754923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  36.21 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 816 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  29.58 
 
 		 491 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  36.21 
 
 		 175 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  45.9 
 
 		 81 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  36.21 
 
 		 149 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 761 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25140  Helix-turn-helix protein  37.93 
 
 		 158 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  33.96 
 
 		 206 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>