More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1540 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  100 
 
 
1187 aa  2462    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.6 
 
 
1065 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.6 
 
 
1065 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  31.27 
 
 
910 aa  119  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  30.1 
 
 
922 aa  118  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.18 
 
 
1160 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.13 
 
 
1172 aa  112  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  34.74 
 
 
928 aa  111  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  31.1 
 
 
915 aa  110  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  34.78 
 
 
889 aa  110  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  31.56 
 
 
924 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 
1170 aa  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.72 
 
 
1170 aa  108  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  26.02 
 
 
964 aa  107  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  29.58 
 
 
1167 aa  105  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  29.49 
 
 
1167 aa  104  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0585  hypothetical protein  27.76 
 
 
529 aa  103  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  30.59 
 
 
1069 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  30.59 
 
 
1069 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.84 
 
 
1137 aa  102  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
1147 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.73 
 
 
1167 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.43 
 
 
1037 aa  100  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 
1136 aa  99.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.38 
 
 
1129 aa  99.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  32.81 
 
 
1169 aa  99  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.64 
 
 
1160 aa  99  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
1046 aa  98.6  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  32.04 
 
 
1169 aa  98.2  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.53 
 
 
969 aa  97.8  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.66 
 
 
584 aa  97.8  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 
1145 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.5 
 
 
1172 aa  97.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.8 
 
 
1116 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  35.32 
 
 
972 aa  96.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.57 
 
 
584 aa  96.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  48.19 
 
 
541 aa  96.3  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.63 
 
 
966 aa  95.9  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  28.53 
 
 
949 aa  95.9  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.64 
 
 
1052 aa  95.5  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  29.1 
 
 
951 aa  95.1  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.57 
 
 
1144 aa  95.1  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  27.13 
 
 
1067 aa  94.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  26.86 
 
 
1170 aa  94.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
933 aa  94.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  33.88 
 
 
760 aa  93.6  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.04 
 
 
1170 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.53 
 
 
835 aa  94  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  30.58 
 
 
906 aa  92.8  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  24.76 
 
 
1083 aa  92.8  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.2 
 
 
988 aa  92.4  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  39.22 
 
 
774 aa  92  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.12 
 
 
941 aa  91.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.12 
 
 
941 aa  91.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  26.46 
 
 
1081 aa  91.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.18 
 
 
962 aa  90.9  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.8 
 
 
829 aa  91.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25 
 
 
971 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  33.33 
 
 
1043 aa  89.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.91 
 
 
1168 aa  89.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  25.23 
 
 
1089 aa  89  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.06 
 
 
1194 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.42 
 
 
952 aa  88.6  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.58 
 
 
969 aa  88.6  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  25.23 
 
 
1117 aa  88.6  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  26.13 
 
 
1051 aa  88.6  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  25.9 
 
 
1075 aa  88.2  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.94 
 
 
919 aa  87.4  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.26 
 
 
1212 aa  86.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.7 
 
 
961 aa  86.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  28.73 
 
 
1077 aa  85.9  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  27.11 
 
 
967 aa  85.5  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.18 
 
 
1138 aa  85.5  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.79 
 
 
1095 aa  85.1  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 
1075 aa  84.7  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  25.62 
 
 
1099 aa  84.7  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  26.33 
 
 
932 aa  84.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  29.57 
 
 
1016 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  24.84 
 
 
1078 aa  84.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  34.02 
 
 
578 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.8 
 
 
915 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.58 
 
 
1153 aa  83.2  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.74 
 
 
1080 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  30.18 
 
 
916 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.51 
 
 
927 aa  82.8  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  30.18 
 
 
915 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  29.39 
 
 
942 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.44 
 
 
1085 aa  82.4  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  32.68 
 
 
1131 aa  82  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.34 
 
 
877 aa  81.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  33.33 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.09 
 
 
921 aa  81.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  28.31 
 
 
963 aa  81.6  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  25.65 
 
 
1069 aa  80.9  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  33.51 
 
 
665 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  28.44 
 
 
1109 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  27.49 
 
 
925 aa  80.1  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  25.87 
 
 
1065 aa  80.1  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  26.89 
 
 
1062 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.46 
 
 
937 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>