293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0418 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  100 
 
 		 297 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  31.39 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  30.59 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  29.3 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  30.17 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  32.17 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  32.2 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30.41 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  29.97 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  32.74 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.99 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.65 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  29.5 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  21.84 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  32.29 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  24.6 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.16 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.47 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  24.51 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25.95 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.37 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  32.5 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  27.65 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  28.18 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  29.44 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.92 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.21 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.41 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  25.83 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.12 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.94 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  28.36 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.98 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.96 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.86 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  25.35 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  31.82 
 
 		 150 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  29.15 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  22.67 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  29.71 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.29 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  28.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  53.45 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  25.63 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  24.31 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  29.34 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  26.4 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.14 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 157 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  26.51 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.19 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.98 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  31.95 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.4 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  23.16 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  31.11 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  28.19 
 
 		 352 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  31.11 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  29.69 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  29.9 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.37 
 
 		 148 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  19.89 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.22 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  28.77 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  23.61 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2471  UspA domain protein  24.17 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  28.1 
 
 		 148 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  23.91 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.03 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  31.75 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  27.87 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  25.73 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  25.68 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  24.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 167 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.46 
 
 		 142 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.01 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  33.11 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  26.88 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  28.26 
 
 		 152 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  31.69 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.97 
 
 		 148 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 153 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>