More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3052 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3052  twitching motility protein  100 
 
 		 387 aa  788    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1694  twitching motility protein  63.38 
 
 		 389 aa  525  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1132  twitching motility protein  56.77 
 
 		 391 aa  424  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1916  twitching motility protein  52.47 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.368763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  46 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  44.54 
 
 		 348 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  43.41 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  44.14 
 
 		 351 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  43.54 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  43.32 
 
 		 351 aa  265  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  41.39 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  42.31 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  42.94 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  43.11 
 
 		 386 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  40.82 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  43.25 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  41.92 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  42.94 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  42.2 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  42.28 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  40.54 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  42.15 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  41.98 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  40.42 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  41.69 
 
 		 360 aa  252  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  44.73 
 
 		 402 aa  252  9.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  38.3 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  42.99 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  40.3 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  41.32 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  41.42 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  41.26 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  37.72 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  41.67 
 
 		 437 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  40.63 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  39.94 
 
 		 374 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  38.38 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  44.09 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  40.69 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  41.41 
 
 		 370 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  40.72 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  42.34 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  41.39 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  41.99 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  42.14 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  38.99 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  38.4 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  40.41 
 
 		 362 aa  243  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  41.05 
 
 		 427 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  41.62 
 
 		 359 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  38.9 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  41.05 
 
 		 427 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  38.9 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  38.02 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  40.56 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  41.05 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  39.47 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  39.76 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  39.52 
 
 		 365 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  39.77 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  39.17 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  38.84 
 
 		 360 aa  239  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  41.95 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  39.83 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  39.03 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  38.87 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  40.41 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  41.8 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  38.98 
 
 		 365 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  38.97 
 
 		 362 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  39.94 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  39.41 
 
 		 346 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  40.58 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  39.7 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  36.6 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  39.31 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  41.84 
 
 		 361 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  39.46 
 
 		 345 aa  235  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  38.29 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  37.91 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  37.91 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  42.61 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  37.08 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0019  twitching motility protein  39.54 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  37.82 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  40.24 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  39.7 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  37.8 
 
 		 368 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  39.7 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  38.11 
 
 		 345 aa  233  5e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  36.26 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  36.95 
 
 		 373 aa  232  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  38.76 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  39.76 
 
 		 381 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  38.81 
 
 		 347 aa  232  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  36.51 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  39.42 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  37.1 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  36.51 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  39.3 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>