264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2017 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3835  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426695  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  38.27 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1875  hypothetical protein  29.46 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  29.69 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  38.57 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3178  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR protein  37.97 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  30.34 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  37.14 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0817  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 167 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1589  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0850023  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  22.5 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29.91 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0096  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1292  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  25.49 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1533  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202577  normal  0.189156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>