More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1764 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  59.56 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1307  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  40.19 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4679  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.136213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  43.33 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  38.37 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  50 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 497 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>