102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4889 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1026  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1678  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1072  TetR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0604431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  24.87 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  24.77 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 218 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 209 aa  45.4  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  32.61 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  22.28 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 194 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 237 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 237 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 214 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 194 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2195  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 220 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 205 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 216 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 233 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>