More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4838 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  39.91 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  42.79 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  43.79 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 192 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  40 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  36.17 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  40.28 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 271 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  25.6 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  18.52 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 330 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  42.03 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  32.35 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>