More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4783 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6966  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  46.05 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  29.32 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  43.28 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  50.75 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  39.58 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  42.35 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 372 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  42.19 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>