199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4572 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  48.09 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  44.75 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  31.96 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  29.11 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  27.91 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 269 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  31.3 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2322  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 310 aa  44.7  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>