161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2812 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  72.4 
 
 		 789 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 611 aa  1272    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  69.57 
 
 		 778 aa  780    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 928 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  44.23 
 
 		 949 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  44.88 
 
 		 757 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  43.03 
 
 		 961 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  41.12 
 
 		 984 aa  412  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  44.23 
 
 		 854 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  42.4 
 
 		 894 aa  365  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  35.19 
 
 		 526 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  35.41 
 
 		 707 aa  323  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  36.02 
 
 		 686 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.49 
 
 		 887 aa  303  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  35.8 
 
 		 739 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  35.04 
 
 		 1759 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 710 aa  270  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  35.25 
 
 		 736 aa  267  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  35.92 
 
 		 730 aa  266  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  37.13 
 
 		 725 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  33.74 
 
 		 1369 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 742 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  35.8 
 
 		 880 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  32.45 
 
 		 737 aa  253  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  33.9 
 
 		 794 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  35.44 
 
 		 990 aa  249  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  32.23 
 
 		 715 aa  249  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.21 
 
 		 985 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  35.5 
 
 		 847 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  33.8 
 
 		 846 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 		 1137 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  31.36 
 
 		 1017 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 649 aa  154  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.93 
 
 		 2042 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  29.03 
 
 		 978 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 895 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  27.4 
 
 		 590 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  25.71 
 
 		 885 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  23.83 
 
 		 646 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  24.78 
 
 		 1601 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  61.84 
 
 		 591 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  66.2 
 
 		 477 aa  94.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  25.39 
 
 		 874 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  26.54 
 
 		 591 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  61.04 
 
 		 415 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  57.89 
 
 		 334 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  46.94 
 
 		 619 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  50 
 
 		 554 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  64.62 
 
 		 571 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  45.1 
 
 		 922 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.13 
 
 		 842 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  23.55 
 
 		 571 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  56.72 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  23.69 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  52.87 
 
 		 900 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  36.97 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  56.72 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  23.02 
 
 		 833 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  48.86 
 
 		 600 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  54.41 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  50.63 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  58.46 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  53.73 
 
 		 639 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  56.41 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  55.07 
 
 		 814 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  58.46 
 
 		 630 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  56 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.86 
 
 		 790 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  47.89 
 
 		 773 aa  73.9  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 1077 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.33 
 
 		 927 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.45 
 
 		 831 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  51.85 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 1224 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  48.1 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  26.01 
 
 		 854 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.89 
 
 		 611 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.37 
 
 		 1051 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  40.22 
 
 		 660 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  47.76 
 
 		 524 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.57 
 
 		 411 aa  67  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  53.85 
 
 		 566 aa  66.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  50.75 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 		 948 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  50 
 
 		 928 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  53.57 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.95 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  48.39 
 
 		 965 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  25.11 
 
 		 775 aa  65.1  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  45.95 
 
 		 558 aa  64.3  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.79 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  47.76 
 
 		 679 aa  63.9  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  47.62 
 
 		 533 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  45.31 
 
 		 982 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  22.05 
 
 		 1100 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  43.42 
 
 		 707 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1890  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.97 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  31.37 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>