More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0674 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  50 
 
 		 292 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  49.83 
 
 		 290 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  49.48 
 
 		 290 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 294 aa  295  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 288 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  35.46 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  34.64 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  32.97 
 
 		 334 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  34.07 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4138  RpiR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.115522 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4602  RpiR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.0896599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  33.21 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0995  RpiR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3194  RpiR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5528  RpiR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  0.847373 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3612  RpiR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4755  RpiR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.207638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0245  RpiR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0235  RpiR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0836166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  26.98 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  25.71 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  27.5 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  24.37 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  24.44 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  23.51 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  26.06 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  24.16 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  25.53 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  24.16 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6012  transcriptional regulator, RpiR family  25.09 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1407  RpiR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  23.02 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  23.4 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  24.06 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3314  transcriptional regulator, RpiR family  23.49 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.82 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3470  transcriptional regulator, RpiR family  24.01 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2412  transcriptional regulator, RpiR family  23.33 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  24.45 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  28.03 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  23 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  23.51 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2807  RpiR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  26.1 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7330  transcriptional regulator  25.59 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0574  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000288568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  24.2 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3246  RpiR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.960864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  22.58 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.11 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  25.33 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1741  hypothetical protein  22.87 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4653  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.562293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2345  RpiR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  24.58 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1089  RpiR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.937606  normal  0.197064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1784  RpiR family transcriptional regulator  20.21 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760228  hitchhiker  0.0000000136615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>