More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4489 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  40.58 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  40.22 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  41.22 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4138  RpiR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.115522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4602  RpiR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.0896599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0995  RpiR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5528  RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  0.847373 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3612  RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4755  RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.207638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3194  RpiR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  31.42 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  30.65 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  33.96 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  31.94 
 
 		 314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0245  RpiR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0235  RpiR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0836166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 287 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  26.64 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  25.83 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  31.05 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  28.94 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  29.96 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  24.22 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  30.12 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  26.01 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0142  RpiR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0986  RpiR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  23.2 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  23.48 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  28.79 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  31.93 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  29.77 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1089  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.937606  normal  0.197064 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4736  RpiR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  27.27 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  27.35 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3802  RpiR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439738  decreased coverage  0.00014335 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3689  hypothetical protein  27.16 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4871  RpiR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211871  hitchhiker  0.00000205236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0770  RpiR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666696  hitchhiker  0.00646712 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  22.49 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0833  RpiR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4354  RpiR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  20.63 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1111  helix-turn-helix protein RpiR  27.07 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3693  RpiR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00637499  normal  0.371267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  23.69 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>