More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1321 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  59.36 
 
 		 297 aa  353  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 291 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 291 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  44.57 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  30.66 
 
 		 329 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  29.93 
 
 		 331 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  31.23 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  32.59 
 
 		 327 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  27.41 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  29.67 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  28.15 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  28.36 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0142  RpiR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0833  RpiR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3246  RpiR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.960864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 317 aa  118  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  29.77 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  26.34 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4049  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00364013  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3568  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00752039  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1089  RpiR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.937606  normal  0.197064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  31.32 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  28.24 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7330  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  27.82 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4429  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.882405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  26.36 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3832  RpiR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.918154  normal  0.315184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  27.4 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4206  RpiR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4160  RpiR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1870  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  0.341017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  27.07 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  26.36 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3356  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0600613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  25.18 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  25.94 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  25.18 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 293 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  27.04 
 
 		 323 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 294 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  25.84 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3607  RpiR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 325 aa  98.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  24.8 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  24.11 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  25.84 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  25.84 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  27.78 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4871  RpiR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211871  hitchhiker  0.00000205236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4354  RpiR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  25.95 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  25.35 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1414  hypothetical protein  24.81 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.983802  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3484  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  25.37 
 
 		 304 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>