219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1915 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  66.07 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  26.39 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  27.92 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  25.28 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  27.03 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  26.86 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  31.94 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  31.13 
 
 		 334 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3194  RpiR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0235  RpiR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0836166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0245  RpiR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  30.63 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  22.5 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3191  RpiR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3450  RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3429  RpiR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3330  RpiR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4871  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211871  hitchhiker  0.00000205236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4354  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3479  transcriptional regulator, RpiR family  29.29 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3470  transcriptional regulator, RpiR family  28.68 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0770  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666696  hitchhiker  0.00646712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2080  transcriptional regulator, RpiR family  32.32 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5365  RpiR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401037  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4138  RpiR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.115522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1089  RpiR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.937606  normal  0.197064 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4602  RpiR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.0896599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0931  RpiR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0628212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3445  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4922  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820717  normal  0.0573558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3314  transcriptional regulator, RpiR family  27.99 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3607  RpiR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3693  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00637499  normal  0.371267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  27.68 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  27.68 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1822  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  29.41 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  27.68 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6012  transcriptional regulator, RpiR family  31.14 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  28.68 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  26.98 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  29.85 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0995  RpiR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0831  hypothetical protein  31.08 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2209  putative DNA-binding protein  31.08 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00094108  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1569  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  31.08 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00731797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0867  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  31.08 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0959  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  31.08 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00212362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0051  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  30.95 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000270259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  23.66 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1764  SIS domain-containing protein  30.28 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000384783  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  24.68 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0450  RpiR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2372  transcriptional regulator, RpiR family  28.73 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  26.48 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0574  RpiR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000288568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1253  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0224504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0175  RpiR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4122  RpiR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  22.78 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>