202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0450 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0450  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  57.52 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2057  RpiR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 272 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2428  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  44.44 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal  0.0398697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3429  RpiR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0931  RpiR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0628212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  36.47 
 
 		 279 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3330  RpiR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3450  RpiR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3191  RpiR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2080  transcriptional regulator, RpiR family  35.82 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3314  transcriptional regulator, RpiR family  35.71 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2787  transcriptional regulator, RpiR family  34.42 
 
 		 296 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0876  transcriptional regulator, RpiR family  37.22 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3470  transcriptional regulator, RpiR family  34.59 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1331  RpiR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2659  RpiR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1233  RpiR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0156819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1407  RpiR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  27.38 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0959  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.396174 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2981  RpiR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 282 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  25.1 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1774  putative transcriptional regulator, RpiR family  29.32 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2324  RpiR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2372  transcriptional regulator, RpiR family  28.11 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3592  RpiR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2180  RpiR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  27.07 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6012  transcriptional regulator, RpiR family  26.87 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1440  hypothetical protein  22.57 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  27.84 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1048  RpiR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1272  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2565  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0245  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0516  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1394  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.061772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1313  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1052  hypothetical protein  23.23 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2807  RpiR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  22.13 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  24.9 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4122  RpiR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  25.48 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2345  RpiR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  30.07 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  41.27 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  22.48 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5365  RpiR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 286 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401037  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3445  RpiR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  23.77 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4922  RpiR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820717  normal  0.0573558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0770  RpiR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666696  hitchhiker  0.00646712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3346  transcriptional regulator, RpiR family  25.97 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4354  RpiR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4871  RpiR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211871  hitchhiker  0.00000205236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  23.7 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4675  RpiR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 336 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0109313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 286 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3443  transcriptional regulator, RpiR family  27.32 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1764  SIS domain-containing protein  23.36 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000384783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3669  transcriptional regulator, RpiR family  25.49 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 299 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3745  transcriptional regulator, RpiR family  28.28 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1111  helix-turn-helix protein RpiR  27.47 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1042  RpiR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1001  RpiR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0574  RpiR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000288568  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0051  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  22.86 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000270259  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0831  hypothetical protein  22.86 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2209  putative DNA-binding protein  22.86 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00094108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0959  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  22.86 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00212362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0867  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  22.86 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1569  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  22.86 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00731797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4002  RpiR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0712  SIS domain-containing protein  25.1 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3779  RpiR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4589  RpiR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3693  RpiR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00637499  normal  0.371267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4354  RpiR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>