135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3443 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3443  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3745  transcriptional regulator, RpiR family  96.83 
 
 		 284 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6012  transcriptional regulator, RpiR family  32.82 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1822  RpiR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2180  RpiR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3592  RpiR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 307 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2807  RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 287 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2324  RpiR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4122  RpiR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1784  RpiR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760228  hitchhiker  0.0000000136615 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1440  hypothetical protein  27.52 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4885  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.21 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586943  normal  0.761042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4060  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2345  RpiR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1272  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2565  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0245  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0516  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1394  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.061772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1313  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1052  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3779  RpiR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4589  RpiR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5716  RpiR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0748827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1255  RpiR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4477  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600704  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4015  RpiR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1048  RpiR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4002  RpiR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0235  RpiR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0836166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0245  RpiR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  22.94 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  25.19 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  24.02 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  25.64 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  24 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3429  RpiR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1407  RpiR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  25.57 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 616 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  25.27 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  19.16 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  24.31 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0931  RpiR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0628212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 287 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  22.64 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  23.88 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3318  iron transport system regulatory protein FitR  24.06 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0450  RpiR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2080  transcriptional regulator, RpiR family  27.14 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4338  iron transport system regulatory protein FitR  23.68 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0876  transcriptional regulator, RpiR family  27.37 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3437  RpiR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  21.48 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  23.32 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2057  RpiR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  21.48 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  18.67 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  34.62 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 641 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1233  RpiR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0156819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  23.64 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3330  RpiR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 641 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 641 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 620 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 620 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 641 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 641 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 620 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3191  RpiR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3450  RpiR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  18.7 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 284 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4602  RpiR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.0896599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4675  RpiR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 336 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0109313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 337 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 639 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  22.34 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 638 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  21.21 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>