More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3330 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 616 aa  1234    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 641 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 641 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 641 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 641 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 638 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 638 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 639 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 641 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 642 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 642 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 642 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 642 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 642 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 642 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 642 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  43.93 
 
 		 332 aa  296  7e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  50.63 
 
 		 339 aa  269  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  45.76 
 
 		 343 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  45.68 
 
 		 336 aa  259  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  42.36 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  42.36 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  42.36 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  46.36 
 
 		 351 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  41.72 
 
 		 322 aa  249  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  46.36 
 
 		 351 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  46.65 
 
 		 351 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  45 
 
 		 330 aa  244  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  41.4 
 
 		 321 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  41.4 
 
 		 321 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  41.4 
 
 		 321 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  41.4 
 
 		 321 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  41.4 
 
 		 321 aa  243  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  40.76 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  242  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  40.76 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  41.08 
 
 		 322 aa  239  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  41.9 
 
 		 321 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  40.65 
 
 		 321 aa  233  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  41.59 
 
 		 321 aa  233  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  36.71 
 
 		 320 aa  232  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  39.49 
 
 		 320 aa  228  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  36.16 
 
 		 330 aa  226  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  45.03 
 
 		 335 aa  225  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  36.08 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  37.11 
 
 		 335 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  37.42 
 
 		 335 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  39.68 
 
 		 316 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  43.35 
 
 		 337 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  40.06 
 
 		 321 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  36.76 
 
 		 321 aa  210  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  35.98 
 
 		 339 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  35.98 
 
 		 341 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  34.19 
 
 		 317 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  39.94 
 
 		 324 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  40.69 
 
 		 318 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  38.56 
 
 		 325 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  36.31 
 
 		 319 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  35.26 
 
 		 329 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 284 aa  193  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  32.81 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 281 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 281 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 281 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  39.94 
 
 		 326 aa  191  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  37.42 
 
 		 322 aa  190  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 282 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 281 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  38.61 
 
 		 281 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5676  RpiR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 323 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  38.28 
 
 		 281 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  37.15 
 
 		 319 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 273 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 281 aa  176  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  36.53 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  36.84 
 
 		 319 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  36.48 
 
 		 328 aa  174  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  34.86 
 
 		 337 aa  174  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  33.76 
 
 		 326 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  36 
 
 		 319 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  37.34 
 
 		 335 aa  173  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  36.53 
 
 		 320 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  35.91 
 
 		 331 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 278 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  33.23 
 
 		 317 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 318 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5350  RpiR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 288 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 289 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5258  RpiR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 288 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  34.89 
 
 		 326 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  38.41 
 
 		 322 aa  167  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>