169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1557 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1557  glucokinase  100 
 
 		 351 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  91.45 
 
 		 351 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  91.45 
 
 		 351 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  46.99 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  52.42 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  50.15 
 
 		 343 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 641 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 641 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 641 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 641 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50 
 
 		 641 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 620 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 620 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 620 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 616 aa  269  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 639 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 642 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 642 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 638 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 642 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 642 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 642 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 642 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 642 aa  262  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  48.9 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 638 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  46.48 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  45.28 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  45.9 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  45.6 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  45.6 
 
 		 321 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  45.6 
 
 		 321 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  45.6 
 
 		 321 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  44.2 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  45.28 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  44.04 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  47.11 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  45.91 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  45.91 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  45.91 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  42.32 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  44.65 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  46.55 
 
 		 339 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  40.62 
 
 		 317 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  40.79 
 
 		 321 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  39.76 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  39.76 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  43.17 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  43.16 
 
 		 339 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  44.61 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  41.41 
 
 		 319 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  39.31 
 
 		 329 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  39.57 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  37.74 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  42.86 
 
 		 331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  36.42 
 
 		 318 aa  212  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  35.54 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  39.38 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  40.91 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  42.11 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  40.73 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  37.88 
 
 		 321 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  39.76 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  40.85 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  40 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  35.57 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  36.28 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  40.24 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  40.31 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  41.61 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  37.12 
 
 		 322 aa  189  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  41.49 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  36.73 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  38.15 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  35.12 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  38.11 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  36.17 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  37.08 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  36.11 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  35.74 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  37.31 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  37.23 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  36.78 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  35.49 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  35.45 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  35.49 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  37.39 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  36.56 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2047  glucokinase  37.27 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865075  normal  0.732847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  32.64 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  34.45 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>