More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0825 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  97.35 
 
 		 642 aa  1249    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  98.29 
 
 		 642 aa  1285    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.58 
 
 		 641 aa  1173    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.94 
 
 		 620 aa  1140    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.73 
 
 		 641 aa  1175    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.73 
 
 		 641 aa  1175    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  97.82 
 
 		 642 aa  1255    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.58 
 
 		 641 aa  1173    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.42 
 
 		 641 aa  1170    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.94 
 
 		 620 aa  1140    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  85.92 
 
 		 638 aa  1095    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  86.38 
 
 		 638 aa  1103    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  91.94 
 
 		 620 aa  1140    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  98.29 
 
 		 642 aa  1285    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  85.31 
 
 		 639 aa  1093    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  99.69 
 
 		 642 aa  1298    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 642 aa  1301    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  98.29 
 
 		 642 aa  1285    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 616 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  47.48 
 
 		 332 aa  296  1e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  46.82 
 
 		 320 aa  277  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  45.89 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  45.89 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  45.89 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  47.15 
 
 		 336 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  45.89 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  45.57 
 
 		 321 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  45.89 
 
 		 321 aa  274  5.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  45.86 
 
 		 323 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  45.86 
 
 		 323 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  45.86 
 
 		 323 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  47.84 
 
 		 351 aa  266  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  47.53 
 
 		 351 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  47.53 
 
 		 351 aa  266  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  43.99 
 
 		 322 aa  263  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  44.59 
 
 		 321 aa  263  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  45.22 
 
 		 322 aa  260  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  46.28 
 
 		 330 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  44.62 
 
 		 321 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  40.88 
 
 		 330 aa  257  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  44.86 
 
 		 343 aa  253  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  44.41 
 
 		 317 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  40.69 
 
 		 318 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  48.41 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  42.41 
 
 		 316 aa  251  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  41.05 
 
 		 321 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  44.62 
 
 		 335 aa  243  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  42.14 
 
 		 335 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  41.72 
 
 		 335 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  42.9 
 
 		 321 aa  238  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  42.04 
 
 		 319 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  47.76 
 
 		 337 aa  234  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  40.95 
 
 		 321 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 281 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  37.9 
 
 		 320 aa  232  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 282 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 281 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 281 aa  226  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 273 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 281 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  46.72 
 
 		 281 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  41.7 
 
 		 281 aa  223  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 284 aa  223  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 278 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 318 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 338 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  43.13 
 
 		 317 aa  220  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  37.65 
 
 		 341 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5676  RpiR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 323 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321786 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  37.24 
 
 		 339 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  39.23 
 
 		 329 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 281 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 282 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  41.48 
 
 		 325 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 282 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 282 aa  210  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 282 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 282 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 282 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71780  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 293 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6227  putative transcriptional regulator  41.8 
 
 		 293 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  40 
 
 		 334 aa  208  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  39.94 
 
 		 326 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  39.81 
 
 		 324 aa  206  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  39.56 
 
 		 322 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 332 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 332 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 332 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 339 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 332 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 332 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>