169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2661 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  100 
 
 
321 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  99.38 
 
 
321 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  99.07 
 
 
321 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  99.38 
 
 
321 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  99.38 
 
 
321 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  92.83 
 
 
321 aa  620  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  93.15 
 
 
321 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  92.52 
 
 
321 aa  618  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  91.59 
 
 
321 aa  605  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  80.95 
 
 
320 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  77.57 
 
 
323 aa  527  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  77.57 
 
 
323 aa  527  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  77.57 
 
 
323 aa  527  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  74.45 
 
 
321 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  71.43 
 
 
322 aa  484  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  68.32 
 
 
322 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  67.91 
 
 
321 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  50.95 
 
 
320 aa  331  8e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  46.95 
 
 
317 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  46.08 
 
 
330 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  44.03 
 
 
318 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  42.77 
 
 
339 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  43.03 
 
 
341 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  42.45 
 
 
335 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  44.19 
 
 
316 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  42.15 
 
 
335 aa  265  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
642 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
641 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  43.75 
 
 
321 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
641 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
642 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
641 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 
641 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.25 
 
 
642 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  43.31 
 
 
332 aa  258  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
620 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
620 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
620 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  47 
 
 
330 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
641 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
642 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
642 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
642 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
642 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
638 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  43.35 
 
 
638 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
639 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.4 
 
 
616 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  42.09 
 
 
321 aa  242  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  43.73 
 
 
317 aa  242  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  44.34 
 
 
339 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  40.65 
 
 
319 aa  238  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  41.48 
 
 
321 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  41.12 
 
 
319 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  40.74 
 
 
320 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  40.12 
 
 
319 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  41.46 
 
 
322 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  39.81 
 
 
319 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  40.97 
 
 
324 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  45.28 
 
 
351 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  45.28 
 
 
351 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  45.28 
 
 
351 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  40 
 
 
343 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  40.06 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  42.27 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  39.22 
 
 
326 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  37.58 
 
 
325 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  39.31 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  38.82 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  38.26 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  38.71 
 
 
342 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  42.11 
 
 
328 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  40.26 
 
 
335 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  40.31 
 
 
321 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  38.74 
 
 
326 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  38.64 
 
 
329 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  40.62 
 
 
321 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  38.11 
 
 
346 aa  205  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  35.33 
 
 
334 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  39.56 
 
 
337 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  38.66 
 
 
326 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  37.42 
 
 
343 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  38.68 
 
 
339 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  36.77 
 
 
343 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  38.41 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  37.54 
 
 
331 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  36.86 
 
 
339 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  38.1 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  35.65 
 
 
326 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  38.82 
 
 
319 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  41.69 
 
 
334 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  37.7 
 
 
341 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  36.54 
 
 
322 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2672  glucokinase  37.5 
 
 
326 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>