175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1783 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  100 
 
 
337 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  52.94 
 
 
330 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  54.1 
 
 
335 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  52.57 
 
 
339 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  45.87 
 
 
319 aa  261  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  41.46 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  46.08 
 
 
336 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
638 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
638 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  49.36 
 
 
641 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  49.04 
 
 
641 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  42.07 
 
 
320 aa  246  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  49.04 
 
 
641 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  49.04 
 
 
641 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  49.04 
 
 
641 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  46.5 
 
 
639 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
642 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
642 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
642 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.72 
 
 
642 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  43.35 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
642 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  46.06 
 
 
343 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
642 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  43.91 
 
 
317 aa  242  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
642 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
620 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
620 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
620 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  42.31 
 
 
321 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
616 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  43.84 
 
 
316 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  41.14 
 
 
321 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  236  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  40.98 
 
 
321 aa  235  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  39.87 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  40.19 
 
 
321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  40.19 
 
 
321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  40.19 
 
 
321 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  40.19 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  42.09 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  41.61 
 
 
320 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  41.14 
 
 
321 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  43.25 
 
 
321 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  39.7 
 
 
330 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  40.85 
 
 
318 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  39.57 
 
 
335 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  39.57 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  45.21 
 
 
351 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  44.48 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  44.48 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  42.49 
 
 
325 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  43.17 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  38.79 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  37.09 
 
 
341 aa  212  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  40.19 
 
 
323 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  40.19 
 
 
323 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  40.19 
 
 
323 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  37.13 
 
 
339 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  41.35 
 
 
317 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  43.31 
 
 
320 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  41.87 
 
 
319 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  39.7 
 
 
321 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  39.58 
 
 
329 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  41.32 
 
 
322 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  40.38 
 
 
326 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  41.57 
 
 
319 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  41.72 
 
 
319 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  41.99 
 
 
326 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  41.85 
 
 
326 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  38.51 
 
 
318 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  42.17 
 
 
339 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  35.29 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  41.27 
 
 
331 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  35.69 
 
 
346 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  34.73 
 
 
324 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  34.08 
 
 
343 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  43.15 
 
 
319 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  37.3 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  39.39 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  39.76 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  33.44 
 
 
343 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  33.95 
 
 
339 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  37.78 
 
 
328 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  40.62 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  39.04 
 
 
321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  38.32 
 
 
321 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  35.85 
 
 
326 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  36.53 
 
 
337 aa  159  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  35.22 
 
 
332 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0832  glucokinase  34.08 
 
 
331 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.889117  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  36.83 
 
 
337 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  34.46 
 
 
345 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>