171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1025 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  100 
 
 
325 aa  648    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  55.37 
 
 
326 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  54.17 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  45.28 
 
 
316 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  40.52 
 
 
332 aa  225  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  38.69 
 
 
321 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  40.66 
 
 
320 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  45.57 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  41.37 
 
 
319 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  37.42 
 
 
321 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  41.53 
 
 
330 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  37.91 
 
 
321 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  37.91 
 
 
321 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  41.31 
 
 
321 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  37.91 
 
 
321 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  37.91 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  36.93 
 
 
321 aa  215  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  43.73 
 
 
326 aa  215  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  37.58 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  37.7 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  37.58 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  37.58 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  37.58 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  43.83 
 
 
324 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  34.19 
 
 
320 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  37.25 
 
 
317 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  40.59 
 
 
319 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  37.7 
 
 
322 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  42.58 
 
 
639 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
638 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  37.01 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  39.6 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  38.03 
 
 
335 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
638 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.56 
 
 
616 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  39.49 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  33.98 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
641 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  38.03 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
641 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
641 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
641 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  38.94 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  43.17 
 
 
351 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  39.94 
 
 
329 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  42.53 
 
 
335 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  42.55 
 
 
351 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  42.55 
 
 
351 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
620 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
620 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
620 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
642 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  41.85 
 
 
337 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
642 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
642 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
642 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  34.27 
 
 
341 aa  192  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  34.27 
 
 
339 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
641 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
642 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
642 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
642 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  39.74 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  41.21 
 
 
313 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  38.87 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  40.99 
 
 
335 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  35.71 
 
 
321 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  43.81 
 
 
334 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  40.63 
 
 
333 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  40.63 
 
 
333 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  37.58 
 
 
318 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  32.9 
 
 
318 aa  185  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  37.62 
 
 
322 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  41.77 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  39.1 
 
 
346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  38.1 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  35.6 
 
 
321 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  38.56 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  40.32 
 
 
333 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3425  glucokinase  36.7 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0648425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  36.45 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  37.46 
 
 
343 aa  178  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01645  glucokinase  35.39 
 
 
332 aa  178  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  37.66 
 
 
343 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1110  glucokinase  37.7 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  39.5 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1119  glucokinase  41.45 
 
 
313 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  35.87 
 
 
324 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  34.47 
 
 
337 aa  169  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  37.18 
 
 
339 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  38.34 
 
 
341 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>