169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2765 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  99.38 
 
 		 321 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  100 
 
 		 321 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  100 
 
 		 321 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  99.69 
 
 		 321 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  100 
 
 		 321 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  93.77 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  93.77 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  93.77 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  93.77 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  93.77 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  93.77 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  93.77 
 
 		 321 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  93.46 
 
 		 321 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  93.15 
 
 		 321 aa  621  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  92.21 
 
 		 321 aa  607  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  81.59 
 
 		 320 aa  547  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  78.19 
 
 		 323 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  78.19 
 
 		 323 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  78.19 
 
 		 323 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  74.77 
 
 		 321 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  72.05 
 
 		 322 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  68.94 
 
 		 322 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  68.22 
 
 		 321 aa  463  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  51.27 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  46.39 
 
 		 330 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  47.27 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  44.03 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  42.77 
 
 		 339 aa  275  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  43.03 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  42.77 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  44.52 
 
 		 316 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  42.46 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 642 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 642 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  43.75 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 642 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 641 aa  258  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 641 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 641 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 641 aa  258  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  43.31 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 620 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 620 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 620 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  47.33 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 642 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 642 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 642 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 642 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 641 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 638 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 638 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 639 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 616 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  43.59 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  42.09 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  44.34 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  41.8 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  40.65 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  41.12 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  40.74 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  40.12 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  41.46 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  39.81 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  41.29 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  40 
 
 		 343 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  45.6 
 
 		 351 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  45.6 
 
 		 351 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  45.6 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  42.27 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  40.06 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  39.54 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  37.91 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  38.82 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  39.31 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  38.26 
 
 		 336 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  38.71 
 
 		 342 aa  212  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00609  glucokinase  42.11 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  38.74 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  40.31 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1530  glucokinase  40.26 
 
 		 335 aa  205  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  40.62 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  38.44 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  35.33 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  38.64 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  38.98 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  39.87 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  37.74 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  39.18 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  37.1 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  38.41 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  38.05 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  36.86 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  35.65 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  38.82 
 
 		 319 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  37.78 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  38.02 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0309  glucokinase  41.69 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  37.7 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  36.54 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>