170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0976 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0976  glucokinase  100 
 
 		 339 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0982  glucokinase  98.2 
 
 		 341 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2390  glucokinase  64.63 
 
 		 318 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.136402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3710  glucokinase  60.06 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0247  glucokinase  61.4 
 
 		 321 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  44.71 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  44.71 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  44.71 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  44.34 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  45.29 
 
 		 320 aa  281  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  43.07 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  42.77 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  42.77 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  42.77 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  42.77 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  44.85 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  42.77 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.108975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  42.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  42.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  42.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  42.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  42.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  42.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  42.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  42.25 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  42.17 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2359  glucokinase  43.03 
 
 		 320 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.66013  hitchhiker  0.000710265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  42.38 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0024  glucokinase  42.73 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.577938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  41.21 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  43.87 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0486  hypothetical protein  43.87 
 
 		 335 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01247  glucokinase  43.47 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.640026  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  38.86 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  39.76 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  36.67 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 639 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  37.24 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  38.89 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 638 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 638 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  36.5 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  36.56 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  37.81 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 641 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 641 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 641 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 		 641 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 641 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3330  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 616 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 620 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 620 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 620 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 642 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  37.04 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 642 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 642 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 642 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  34.73 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3695  glucokinase  36.72 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  34.57 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  35.91 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1025  glucokinase  34.27 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6478  glucokinase  34.88 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  36.28 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  34.94 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  35.15 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  34.57 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  34.64 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  35.67 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  33.93 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  34.59 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3788  glucokinase  37.24 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4865  glucokinase  37.24 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  34.9 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  35.4 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1783  glucokinase  37.5 
 
 		 337 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  33.43 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1557  glucokinase  35.57 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  33.73 
 
 		 319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  34.05 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  34.47 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  34.57 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1347  glucokinase  34.04 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.836819  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  34.64 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  35.17 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  35.5 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  34.81 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  33.74 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  34.34 
 
 		 337 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  32.95 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  34.38 
 
 		 341 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  33.33 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  32.95 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  34.65 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  33.33 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  36.31 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>