More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2922 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  79.36 
 
 		 287 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0235  RpiR family transcriptional regulator  79.36 
 
 		 287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0836166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0245  RpiR family transcriptional regulator  79.36 
 
 		 287 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  42.7 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3194  RpiR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  36.19 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 292 aa  138  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  37.45 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  36.03 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  29.23 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  28.94 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4602  RpiR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.0896599 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  32.68 
 
 		 314 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4138  RpiR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.115522 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  32.28 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5528  RpiR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  0.847373 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3612  RpiR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4755  RpiR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.207638 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0995  RpiR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  30.74 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  29.03 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  28.63 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1033  RpiR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  26.62 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  23.31 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6012  transcriptional regulator, RpiR family  29.93 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  26.27 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1001  RpiR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  27.17 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  28.62 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  25.81 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1152  RpiR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1822  RpiR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1111  helix-turn-helix protein RpiR  32.46 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4122  RpiR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3695  RpiR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  21.81 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  25.09 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1082  DNA-binding transcriptional regulator HexR  34.48 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474941  unclonable  0.00000000000467577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3607  RpiR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  25.5 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0986  RpiR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1048  RpiR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  24.91 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1741  hypothetical protein  29.18 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  25.29 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1411  transcriptional regulator, RpiR family  27.82 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  24.71 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  25.29 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  29.61 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  26.15 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5365  RpiR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401037  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3689  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3445  RpiR family transcriptional regulator  27 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4922  RpiR family transcriptional regulator  27 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820717  normal  0.0573558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>