More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0292 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  44.57 
 
 		 287 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  41.34 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  30.15 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  25.36 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0142  RpiR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  31.42 
 
 		 320 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  30.65 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3246  RpiR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.960864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0833  RpiR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 327 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3832  RpiR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.918154  normal  0.315184 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  27.34 
 
 		 321 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  29.2 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3568  RpiR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 316 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00752039  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4049  RpiR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00364013  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  27.86 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  29.3 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7330  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  26.1 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1089  RpiR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.937606  normal  0.197064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  26.42 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  27.86 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1870  RpiR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  0.341017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  25.37 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 303 aa  99  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4429  RpiR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.882405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1136  transcriptional regulator, RpiR family  26.44 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  22.46 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4206  RpiR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4160  RpiR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0983  transcriptional regulator, RpiR family  26.36 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3356  RpiR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0600613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  28 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  27.44 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0986  RpiR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1500  RpiR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2002  RpiR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  22.11 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  26.85 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1033  RpiR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0421  transcriptional regulator, RpiR family  23.97 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3797  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0556618 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  23.91 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  27.1 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3607  RpiR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  23.44 
 
 		 314 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4058  RpiR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369796  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 296 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 284 aa  89  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1414  hypothetical protein  24.24 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.983802  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3484  RpiR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3563  RpiR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123663 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1042  RpiR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  25.19 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  24.07 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  27.46 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>