More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2896 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  96.55 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2133  RpiR family transcriptional regulator  71.58 
 
 		 292 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  61.13 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 288 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 288 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 299 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  48.77 
 
 		 294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  35.64 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  32.84 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4602  RpiR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.0896599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4138  RpiR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.115522 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  32.84 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  32.1 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0995  RpiR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4755  RpiR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.207638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5528  RpiR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  0.847373 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3612  RpiR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0245  RpiR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0235  RpiR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 287 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0836166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  29.5 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3194  RpiR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  25.37 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1915  RpiR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  25.36 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  22.94 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  28.37 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  24.3 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  28.98 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  29.81 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  28.62 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  22.87 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1741  hypothetical protein  24.41 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.94 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  26.59 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  26.69 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  26.69 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  24.06 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  26.19 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3314  transcriptional regulator, RpiR family  22.91 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15700  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.07 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0624  RpiR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768777  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  24.71 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7330  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.18 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  26.33 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  24 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  26.33 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  26.32 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.51 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2540  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.16 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0495107  normal  0.0835263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  23.81 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0421  transcriptional regulator, RpiR family  25.95 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  25.47 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  22.73 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2069  DNA-binding transcriptional regulator HexR  22.49 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000131353  hitchhiker  0.000414379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  22.76 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1048  RpiR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3470  transcriptional regulator, RpiR family  22.87 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  25.22 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>