143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4060 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4060  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4477  RpiR family transcriptional regulator  89.15 
 
 		 294 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600704  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1255  RpiR family transcriptional regulator  88.63 
 
 		 299 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3779  RpiR family transcriptional regulator  89.49 
 
 		 295 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4015  RpiR family transcriptional regulator  88.29 
 
 		 297 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4589  RpiR family transcriptional regulator  89.49 
 
 		 295 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5716  RpiR family transcriptional regulator  89.49 
 
 		 295 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0748827 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1272  hypothetical protein  79.66 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2565  hypothetical protein  79.66 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1440  hypothetical protein  78.64 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.520866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0245  hypothetical protein  79.66 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0516  hypothetical protein  79.66 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1394  hypothetical protein  79.66 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.061772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1313  hypothetical protein  79.66 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1052  hypothetical protein  79.66 
 
 		 296 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4885  putative transcriptional regulator, RpiR family  75 
 
 		 298 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586943  normal  0.761042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4002  RpiR family transcriptional regulator  77.4 
 
 		 292 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1784  RpiR family transcriptional regulator  74.32 
 
 		 298 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760228  hitchhiker  0.0000000136615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2345  RpiR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 290 aa  349  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6012  transcriptional regulator, RpiR family  33.22 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2807  RpiR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2180  RpiR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3592  RpiR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2324  RpiR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1822  RpiR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4122  RpiR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 326 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal  0.256061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1048  RpiR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3745  transcriptional regulator, RpiR family  25.84 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.343445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3443  transcriptional regulator, RpiR family  25.84 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  24.24 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0684  putative transcriptional regulator  26.87 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.615346  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0730  transcriptional regulator, putative  25.09 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1605  RpiR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1966  transcriptional regulator, RpiR family  26.6 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.166735  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5348  RpiR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.391246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4614  transcriptional regulator, RpiR family  24.34 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3411  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2659  RpiR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4736  RpiR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  20.34 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  22.55 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  23.25 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1331  RpiR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2981  RpiR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  22.55 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  22.26 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  22.97 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  23.32 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1774  putative transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4138  RpiR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.115522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2057  RpiR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2080  transcriptional regulator, RpiR family  24.07 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0674  RpiR family transcriptional regulator  19.71 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  25.78 
 
 		 375 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  23.05 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 293 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  26.56 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3612  RpiR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4755  RpiR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.207638 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5528  RpiR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  0.847373 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4602  RpiR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.0896599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  26.63 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  20.18 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  23.21 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2428  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  23.93 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.451037  normal  0.0398697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.83 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  23.81 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0876  transcriptional regulator, RpiR family  22.98 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  23.46 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  20.45 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0995  RpiR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  23.9 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3330  RpiR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3191  RpiR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1368  RpiR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.53441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3450  RpiR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2787  transcriptional regulator, RpiR family  23.96 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1253  RpiR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0224504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3445  RpiR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4922  RpiR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820717  normal  0.0573558 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3689  hypothetical protein  22.63 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  37.14 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>