More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1993 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 
280 aa  564  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  37.73 
 
 
284 aa  208  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 
284 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  37 
 
 
284 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  36.63 
 
 
284 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
280 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  37 
 
 
284 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  43.93 
 
 
280 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
273 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
278 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  33.45 
 
 
281 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 
281 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
318 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  35.36 
 
 
272 aa  167  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  34.23 
 
 
292 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
338 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
279 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
339 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2447  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
339 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3409  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3444  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2634  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
279 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0365  RpiR family transcriptional regulator  33.21 
 
 
332 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1216  RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
334 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
282 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
282 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
282 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
282 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
282 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
282 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
282 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  31.76 
 
 
282 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  30.51 
 
 
333 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2041  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
289 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1361  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  hitchhiker  0.000131827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2046  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2101  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.928102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1237  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.101978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
289 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  30.92 
 
 
283 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.38 
 
 
289 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.9 
 
 
301 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.9 
 
 
301 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1333  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0116463  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
284 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2589  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00161066  normal  0.817634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01824  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.39 
 
 
289 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000364184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1787  transcriptional regulator, RpiR family  29.39 
 
 
289 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1779  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0686365  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
641 aa  148  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01812  hypothetical protein  29.39 
 
 
289 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000387969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2083  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.688583  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.18 
 
 
289 aa  148  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
620 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
641 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
620 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.54 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  30.35 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.47 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
641 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
641 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2360  DNA-binding transcriptional regulator HexR  34.83 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190607 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
620 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.39 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
639 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.47 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
641 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
642 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
642 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.18 
 
 
289 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
642 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7211  transcriptional regulator, RpiR family  32.61 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84474  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1082  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474941  unclonable  0.00000000000467577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2422  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.75 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0329148  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
642 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
642 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
642 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
642 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0969  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.48 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.22 
 
 
282 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  29.23 
 
 
299 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
638 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
638 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
281 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
281 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 
315 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
281 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.6 
 
 
284 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  30.43 
 
 
281 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
281 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
292 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>