More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4022 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 320 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  68.93 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  63.79 
 
 		 327 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  65.07 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  62.88 
 
 		 304 aa  353  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  62.28 
 
 		 322 aa  342  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  52.8 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  50 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  49.82 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 280 aa  242  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  47.16 
 
 		 319 aa  236  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  46.13 
 
 		 342 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  48.75 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0151  transcriptional regulator, RpiR family  46.29 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  43.28 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2853  transcriptional regulator, RpiR family  49.43 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  43.21 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  33.92 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  33.92 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  35.61 
 
 		 281 aa  192  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  36.75 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 284 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  33.08 
 
 		 292 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  36.36 
 
 		 279 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  31.34 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 293 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  31.85 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1835  DNA-binding transcriptional regulator HexR  34.9 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 281 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1799  RpiR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0770  transcriptional regulator, RpiR family  39.13 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000975666  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  30.35 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 282 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5350  RpiR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4485  RpiR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  31.88 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  27.21 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6227  putative transcriptional regulator  34.31 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5258  RpiR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 288 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71780  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5399  RpiR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5127  RpiR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 288 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.334763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2814  transcriptional regulator, RpiR family  34.73 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02030  transcriptional regulatory protein HexR  33.68 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5515  transcriptional regulator, RpiR family  33.94 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  31.23 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  31.23 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7211  transcriptional regulator, RpiR family  35.61 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3802  RpiR family transcriptional regulator  36 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439738  decreased coverage  0.00014335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  32.31 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  34.4 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  30.53 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4054  RpiR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544392  normal  0.902505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  30.88 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5064  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  34.98 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.95 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  31.95 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  28.62 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 281 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  31.95 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  33.59 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3998  transcriptional regulator, RpiR family  32.43 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 285 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>