More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2756 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  53.05 
 
 
320 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  52.08 
 
 
333 aa  271  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 
315 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  51.72 
 
 
304 aa  265  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  51.52 
 
 
285 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  50.69 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  51.07 
 
 
322 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
304 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3507  transcriptional regulator, RpiR family  47.18 
 
 
342 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0619346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  41.09 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
320 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
284 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
284 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  32.74 
 
 
281 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  39.01 
 
 
304 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  34.63 
 
 
284 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  34.63 
 
 
284 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  34.28 
 
 
284 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  41.28 
 
 
319 aa  175  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0151  transcriptional regulator, RpiR family  41.24 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15102  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2853  transcriptional regulator, RpiR family  41.2 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  29.41 
 
 
282 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  35.84 
 
 
291 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  34.86 
 
 
287 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  29.55 
 
 
292 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  34.88 
 
 
307 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  34.17 
 
 
304 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  41.76 
 
 
291 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
638 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
620 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
641 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
641 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
620 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
641 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
641 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
638 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
641 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.26 
 
 
620 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  31.64 
 
 
293 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
293 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
293 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
293 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
284 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
642 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
642 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
639 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0969  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.39 
 
 
284 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
283 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  36.74 
 
 
270 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
292 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.46 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.46 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1799  RpiR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
284 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  33.09 
 
 
279 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2242  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00123484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2174  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271639  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4528  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2255  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000281724  hitchhiker  0.00000550313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1865  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7211  transcriptional regulator, RpiR family  35.53 
 
 
287 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84474  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  27.48 
 
 
272 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
289 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2490  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2047  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1928  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0915843  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.7 
 
 
284 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  31.71 
 
 
286 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2152  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
284 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0423  RpiR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
287 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  33.96 
 
 
283 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2540  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.7 
 
 
284 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0495107  normal  0.0835263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.94 
 
 
284 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.46 
 
 
284 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.32 
 
 
289 aa  142  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
281 aa  142  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  35.34 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  28.29 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.08 
 
 
308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2041  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.84 
 
 
289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1237  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.84 
 
 
289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.101978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2101  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.84 
 
 
289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.928102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2422  DNA-binding transcriptional regulator HexR  34.6 
 
 
289 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0329148  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2046  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.84 
 
 
289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>