More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0731 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  98.61 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  98.95 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  98.61 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  98.61 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  98.61 
 
 		 287 aa  581  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  98.95 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  98.95 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  97.91 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  97.21 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  87.11 
 
 		 287 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  72.63 
 
 		 286 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2814  transcriptional regulator, RpiR family  67.14 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  34.78 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  32.44 
 
 		 320 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  33.58 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  32.97 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  31.87 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  30.04 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  36.23 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15700  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.75 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  31.47 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.6 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  32.39 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  31.52 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3144  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.92 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0232322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  30.74 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.94 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.91 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.16 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  33.46 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23060  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.16 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612438 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4203  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.91 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4364  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.91 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1059  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.91 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1021  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.91 
 
 		 290 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1019  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.91 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  30.12 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  29.48 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.54 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  29.54 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5676  RpiR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0969  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.35 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1119  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.12 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.942787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2360  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.37 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1299  Hex regulon repressor  28.12 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.776105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  30.94 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.97 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 338 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.08 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  28.41 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.66 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.86 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  31.42 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3444  RpiR family transcriptional regulator  30 
 
 		 339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1223  RpiR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 339 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.78 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.41 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  29.07 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1333  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.66 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0116463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0070  RpiR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2589  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.66 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00161066  normal  0.817634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01824  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.66 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000364184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1787  transcriptional regulator, RpiR family  30.66 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1779  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.66 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0686365  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.66 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 266 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01812  hypothetical protein  30.66 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000387969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6227  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 320 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.75 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>