More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1774 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1774  putative transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 288 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  55.71 
 
 		 323 aa  258  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0574  RpiR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 295 aa  251  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000288568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1111  helix-turn-helix protein RpiR  51.71 
 
 		 283 aa  214  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1001  RpiR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1411  transcriptional regulator, RpiR family  44.4 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  25.09 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  23.79 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0421  transcriptional regulator, RpiR family  33.18 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  28.41 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  28.24 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3592  RpiR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2180  RpiR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2324  RpiR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3689  hypothetical protein  29.51 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.494088 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0450  RpiR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  23.55 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  27.9 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  29.34 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2636  transcriptional regulator, RpiR family  26.18 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  26.18 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7330  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  29 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  23.79 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0906  transcriptional regulator, RpiR family  28.63 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.505749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3607  RpiR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  29 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  29 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  29 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0833  RpiR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6307  hypothetical protein  30.34 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  29 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  28.62 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  25.94 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1414  hypothetical protein  28.42 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.983802  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3484  RpiR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72650  hypothetical protein  30.34 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  26.32 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1872  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4675  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0109313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  25.09 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2807  RpiR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4338  iron transport system regulatory protein FitR  25.28 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0876  transcriptional regulator, RpiR family  31.21 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4066  RpiR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3318  iron transport system regulatory protein FitR  25.28 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873687 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  24.72 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2922  RpiR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4477  RpiR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.600704  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  24.72 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7853  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.27 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3429  RpiR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3158  transcriptional regulator, RpiR family  48.28 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4002  RpiR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  26.82 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4060  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0160  RpiR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  24.43 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3779  RpiR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4589  RpiR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4489  RpiR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  26.02 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3479  transcriptional regulator, RpiR family  28.29 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2753  transcriptional regulator, RpiR family  29.22 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4015  RpiR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5716  RpiR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0748827 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3797  RpiR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0556618 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  35.37 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  35.37 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4885  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.57 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586943  normal  0.761042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3437  RpiR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2324  RpiR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284245  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0998  RpiR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.962944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  24.51 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1142  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1248  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.964935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>