More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3158 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3158  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
287 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
291 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
291 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 
297 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  26.94 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  27.49 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  26.04 
 
 
302 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  26.39 
 
 
277 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  26.64 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  25.36 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3100  RpiR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  27.31 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  25.36 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  26.92 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  25.36 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  28.09 
 
 
311 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  27.41 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  25.72 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  23.76 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  27.5 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  24.63 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  25.19 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  27.5 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2033  transcriptional regulator, RpiR family  26.22 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.418875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3702  RpiR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  23.22 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  23.64 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1140  RpiR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545053  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3563  RpiR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.123663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  27.72 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4049  RpiR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00364013  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3568  RpiR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00752039  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0142  RpiR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4532  RpiR family transcriptional regulator  25.1 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.872483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0260  transcriptional regulator, RpiR family  27.84 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.379912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  24.28 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  24.44 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  23.92 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  28.25 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5469  transcriptional regulator, RpiR family  30.45 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0712  SIS domain-containing protein  29.23 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  22.78 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4542  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  26.67 
 
 
304 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  24.45 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  26.13 
 
 
329 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1233  RpiR family transcriptional regulator  26.18 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0156819  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3899  RpiR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0299116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3836  RpiR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  26.56 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  26.69 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  25.7 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2412  transcriptional regulator, RpiR family  26.45 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3546  RpiR family transcriptional regulator  25.09 
 
 
280 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3246  RpiR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
312 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.960864  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0876  transcriptional regulator, RpiR family  25.97 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2080  transcriptional regulator, RpiR family  25.91 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3356  RpiR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0600613  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
285 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2349  RpiR family transcriptional regulator  24.48 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4206  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2392  sugar isomerase (SIS)  24.48 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3876  RpiR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4160  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
314 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  24.81 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  27.21 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5218  RpiR family transcriptional regulator  28.2 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.398124 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  20.97 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  23.48 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  22.92 
 
 
286 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>