More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0584 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 288 aa  594  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 291 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0833  RpiR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 327 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1110  SIS domain-containing protein  31.5 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1857  RpiR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3133  transcriptional regulator, RpiR family  28.29 
 
 		 327 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.98235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0327  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3603  transcriptional regulator, RpiR family  26.91 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1772  RpiR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.441713  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0972  SIS domain-containing protein  30.31 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.104915  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0406  RpiR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 314 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1321  transcriptional regulator, RpiR family  24.35 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  23.91 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1363  RpiR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0235  RpiR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1734  transcriptional regulator, RpiR family  23.22 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 278 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  27.17 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3855  RpiR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4228  RpiR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4206  RpiR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4160  RpiR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  28 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  26.04 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  28 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1929  RpiR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434448  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1870  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  0.341017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1140  RpiR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1405  RpiR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0502817  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0175  RpiR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0397  sugar isomerase (SIS)  25 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0831  hypothetical protein  27.78 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111957  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0959  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00212362  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2209  putative DNA-binding protein  27.78 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00094108  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0867  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0770  RpiR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666696  hitchhiker  0.00646712 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1569  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00731797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3568  RpiR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00752039  normal  0.377039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4049  RpiR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00364013  normal  0.771447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3356  RpiR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0600613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1764  SIS domain-containing protein  28.06 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000384783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0051  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  27.38 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000270259  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3000  transcriptional regulator, RpiR family  27.34 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5365  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401037  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3445  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149889  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  23.28 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4588  RpiR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4922  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820717  normal  0.0573558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1316  transcriptional regulator, RpiR family  27.44 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.011222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4871  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211871  hitchhiker  0.00000205236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4354  RpiR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339513  unclonable  0.00000424592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1250  transcriptional regulator, RpiR family  27.44 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229543  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0706  RpiR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4429  RpiR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.882405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2002  RpiR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  28.85 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  27.41 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3693  RpiR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00637499  normal  0.371267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1377  hypothetical protein  25.78 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.478089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  25.45 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3669  transcriptional regulator, RpiR family  23.58 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  25.54 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5218  RpiR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.398124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4575  RpiR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3346  transcriptional regulator, RpiR family  23.98 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  21.71 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4736  RpiR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5469  transcriptional regulator, RpiR family  27.05 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1089  RpiR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.937606  normal  0.197064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  23.99 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2896  transcriptional regulator, RpiR family  24.06 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1884  RpiR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0567682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  26.79 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1042  RpiR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  22.27 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  23.6 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3695  RpiR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1741  hypothetical protein  22.83 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4058  RpiR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369796  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0894  transcriptional regulator  25.8 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3702  RpiR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3797  RpiR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0556618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0624  RpiR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768777  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3832  RpiR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.918154  normal  0.315184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1655  RpiR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>