184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4354 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4354  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4338  iron transport system regulatory protein FitR  50.51 
 
 		 295 aa  289  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3318  iron transport system regulatory protein FitR  50.51 
 
 		 295 aa  288  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3437  RpiR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 295 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.470052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0717  transcriptional regulator protein  48.28 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4675  RpiR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0109313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2372  transcriptional regulator, RpiR family  29.76 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  26.01 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  29.44 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  26.01 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  27.05 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0837  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 642 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0825  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2433  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 642 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4068  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0150237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0625  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0486  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1770  transcriptional regulator  27.04 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000030583  hitchhiker  0.000572207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0965  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0926  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 638 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 638 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  26.14 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3090  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 641 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3001  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 641 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3055  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 641 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.570164  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1550  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 641 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  22.46 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0778  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2612  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.85018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2002  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2132  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3787  transcriptional regulator, RpiR family  29.87 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.925929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4864  transcriptional regulator, RpiR family  29.87 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403808 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1556  putative transcription regulation repressor HEXR transcription regulator protein  29.63 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  23.24 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  24.92 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  26 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  30.43 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0450  RpiR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  28.67 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  22.34 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1124  RpiR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.673079  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  29.93 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2376  transcriptional regulator, RpiR family  35.8 
 
 		 119 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  20.28 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  22.92 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  22.61 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  22.61 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  25.93 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  24.91 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  21.93 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02491  putative rpiR-family transcriptional regulatory protein  26.34 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  28.31 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  24.05 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  22.06 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  23.59 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 282 aa  49.7  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  21.71 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  23.51 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  21.68 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  20.6 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 285 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2822  RpiR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 290 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  24.26 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2832  RpiR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  24.14 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  20.96 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  22.9 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  25.18 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2801  RpiR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  21.68 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>