More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2376 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2376  transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 
119 aa  247  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  98.08 
 
 
284 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  98.08 
 
 
284 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  97.12 
 
 
284 aa  209  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  93.27 
 
 
284 aa  204  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  89.42 
 
 
284 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
296 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1970  RpiR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
299 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  50.62 
 
 
281 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1162  RpiR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164823  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
280 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  40.85 
 
 
279 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  39.22 
 
 
285 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
293 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2832  RpiR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.233384  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
266 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
284 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0070  RpiR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
269 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
266 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  41.76 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  31.73 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4646  transcriptional regulator, RpiR family  36 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.308947  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0607  RpiR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  37.14 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0593  RpiR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590128  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  37.14 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  37.14 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  34.78 
 
 
280 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  41.98 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2984  sugar isomerase (SIS)  37.14 
 
 
319 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  34.65 
 
 
278 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
290 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
308 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  34 
 
 
292 aa  63.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2540  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.66 
 
 
284 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0495107  normal  0.0835263 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.66 
 
 
284 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  42.25 
 
 
298 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2619  RpiR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
286 aa  63.5  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  29.25 
 
 
327 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.76 
 
 
284 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  31.73 
 
 
333 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2468  RpiR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
296 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2589  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.23 
 
 
289 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00161066  normal  0.817634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.56 
 
 
284 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  36.67 
 
 
283 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
289 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  29.9 
 
 
320 aa  62  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.38 
 
 
289 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1333  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.23 
 
 
289 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0116463  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.74 
 
 
284 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.55 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00123484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2490  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.74 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4528  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1082  DNA-binding transcriptional regulator HexR  37.38 
 
 
288 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000474941  unclonable  0.00000000000467577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2255  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000281724  hitchhiker  0.00000550313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.55 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2174  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271639  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2242  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2047  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.74 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1928  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.74 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0915843  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2152  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.74 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1865  DNA-binding transcriptional regulator HexR  38.54 
 
 
284 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01824  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.08 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000364184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1787  transcriptional regulator, RpiR family  39.08 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
293 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
293 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  41.38 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.08 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90466  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01812  hypothetical protein  39.08 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000387969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3272  RpiR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
289 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.854433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
338 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  38.46 
 
 
293 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.08 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1779  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.08 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0686365  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
293 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
292 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.71 
 
 
289 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2753  transcriptional regulator, RpiR family  37.14 
 
 
304 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
292 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
292 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  44.26 
 
 
272 aa  61.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0178  RpiR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
291 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2069  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.56 
 
 
284 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000131353  hitchhiker  0.000414379 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0183  helix-turn-helix protein RpiR  32.11 
 
 
291 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  41.77 
 
 
282 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  41.54 
 
 
304 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4485  RpiR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
288 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6227  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
293 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71780  RpiR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
293 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2083  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.08 
 
 
289 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.688583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  31.11 
 
 
274 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15700  DNA-binding transcriptional regulator HexR  34.95 
 
 
288 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2360  DNA-binding transcriptional regulator HexR  39.74 
 
 
286 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01243  DNA-binding transcriptional regulator HexR  36.36 
 
 
283 aa  58.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2422  DNA-binding transcriptional regulator HexR  40.23 
 
 
289 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0329148  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2045  putative transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 
291 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1835  DNA-binding transcriptional regulator HexR  35.87 
 
 
290 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>