187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2717 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2717  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 531 aa  1066    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2173  flagellar M-ring protein FliF  25.9 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2051  flagellar M-ring protein FliF  25.95 
 
 		 523 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  24.72 
 
 		 503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0465  flagellar M-ring protein FliF  24.78 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  26.14 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  22.41 
 
 		 570 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  22.2 
 
 		 566 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  23.4 
 
 		 527 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  25.3 
 
 		 535 aa  90.1  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  22.56 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  24.7 
 
 		 558 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  22.58 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  23.19 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  23.19 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  22.16 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  22.14 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  21.99 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  25.23 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  22.7 
 
 		 540 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  24.05 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  21.66 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  22.66 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  23.64 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  25.5 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  23.73 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  21.55 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  20.26 
 
 		 519 aa  73.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  22.83 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  22.83 
 
 		 611 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  24.76 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  22.18 
 
 		 544 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  20.7 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  20.66 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4655  flagellar MS-ring protein  23.44 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702143  normal  0.459158 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  22.83 
 
 		 611 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  21.92 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  24.74 
 
 		 548 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  23.48 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  21.48 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  21.52 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  23.57 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  23.75 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  22.46 
 
 		 538 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  21.1 
 
 		 559 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  22.46 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  23.88 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  24.15 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  23.55 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  21.97 
 
 		 567 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  25.12 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  25.12 
 
 		 559 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  25.12 
 
 		 570 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  22.36 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  21.48 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  22.19 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  20.72 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  21.43 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  21.51 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  22.31 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  25.58 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  22.34 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  21.52 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  22.48 
 
 		 600 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  21.24 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  22.6 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  20.04 
 
 		 587 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  24.51 
 
 		 568 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  21.34 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1717  flagellar MS-ring protein  24.76 
 
 		 580 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.869782  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4417  flagellar MS-ring protein  23.92 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.411819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2003  flagellar MS-ring protein  24.77 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  21.23 
 
 		 572 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  23.08 
 
 		 587 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  22.48 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  23.08 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  22.68 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  22.69 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  23.11 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  22.69 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  22.69 
 
 		 587 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  24.66 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  22.44 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  22.91 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  24.44 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  22.36 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  23.81 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1012  flagellar MS-ring protein  25.45 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357656  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  23.36 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0171  flagellar MS-ring protein  24.12 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0234  flagellar MS-ring protein  22.22 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.151863  normal  0.235707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0286  flagellar MS-ring protein  23.47 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.722484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0711  flagellar MS-ring protein  22.22 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.633063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  22.36 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  21.88 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  22.26 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  22.26 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  22.36 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  20.97 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  24.26 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>