247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2051 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2051  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 523 aa  1051    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0465  flagellar M-ring protein FliF  42.99 
 
 		 517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2173  flagellar M-ring protein FliF  33.1 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  29.64 
 
 		 503 aa  217  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  25.95 
 
 		 519 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  26.11 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  25.57 
 
 		 516 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  26.73 
 
 		 537 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  25.19 
 
 		 533 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  25.39 
 
 		 537 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  24.11 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  24.37 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  26.23 
 
 		 528 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  26.69 
 
 		 525 aa  124  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  26.8 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  24.65 
 
 		 530 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  26.75 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  25.52 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  24.35 
 
 		 527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  26.68 
 
 		 552 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  26.68 
 
 		 552 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  26.68 
 
 		 552 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  25.05 
 
 		 587 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  26.68 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  26.43 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  24.05 
 
 		 587 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  24.35 
 
 		 512 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  24.21 
 
 		 524 aa  114  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  26.43 
 
 		 552 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  25.25 
 
 		 540 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  25 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  24.81 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  24.86 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  24.86 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  24.86 
 
 		 576 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  24.86 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  23.51 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  23.51 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  23.93 
 
 		 600 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  25.79 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  25.79 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  25.79 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  27.3 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2717  flagellar M-ring protein FliF  25.95 
 
 		 531 aa  109  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  25.55 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  24.19 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  26.82 
 
 		 677 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  25.54 
 
 		 580 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  25.5 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  25.8 
 
 		 524 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  23.51 
 
 		 570 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  24.06 
 
 		 518 aa  107  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1457  flagellar MS-ring protein  24.6 
 
 		 538 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  25.36 
 
 		 598 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  25.36 
 
 		 598 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  25.36 
 
 		 598 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  24.91 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1573  flagellar M-ring protein FliF  24.76 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  25.36 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  28.34 
 
 		 539 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  26.16 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  25.36 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  25.36 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  25.51 
 
 		 587 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  25.36 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  24.37 
 
 		 505 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  23.27 
 
 		 611 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  23.93 
 
 		 567 aa  104  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  25.12 
 
 		 590 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  25.26 
 
 		 532 aa  103  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  23.55 
 
 		 576 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1876  flagellar MS-ring protein  25.14 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  23.36 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0691  flagellar MS-ring protein  25.72 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  23.11 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0353  flagellar M-ring protein FliF  26.25 
 
 		 539 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  23.44 
 
 		 498 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  24.84 
 
 		 532 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  28.27 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  28.27 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  26.39 
 
 		 534 aa  100  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  24.25 
 
 		 552 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  24.79 
 
 		 593 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  23.36 
 
 		 535 aa  99.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  22.16 
 
 		 569 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  24.19 
 
 		 568 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  23.56 
 
 		 570 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  23.73 
 
 		 561 aa  97.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  21.56 
 
 		 513 aa  97.1  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  20.35 
 
 		 552 aa  96.7  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  23.66 
 
 		 595 aa  96.3  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  23.62 
 
 		 559 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1272  flagellar MS-ring protein  22.78 
 
 		 532 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000378845  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0569  flagellar M-ring protein FliF  22.65 
 
 		 504 aa  93.2  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  22.59 
 
 		 529 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  26.74 
 
 		 572 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  23.08 
 
 		 531 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  24.2 
 
 		 563 aa  90.5  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  24.17 
 
 		 567 aa  90.1  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1389  flagellar M-ring protein FliF  25.6 
 
 		 507 aa  90.1  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>