244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0465 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0465  flagellar M-ring protein FliF  100 
 
 		 517 aa  1046    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2051  flagellar M-ring protein FliF  42.99 
 
 		 523 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2173  flagellar M-ring protein FliF  32.45 
 
 		 560 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  27.29 
 
 		 503 aa  171  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  26.37 
 
 		 519 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1373  flagellar M-ring protein FliF  26.36 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.522807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  27.67 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  25.46 
 
 		 519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  25.87 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  24.91 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  24.87 
 
 		 524 aa  108  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  29.09 
 
 		 532 aa  107  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  25.54 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  28.13 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  28.61 
 
 		 532 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  23.12 
 
 		 533 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  25.28 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2717  flagellar M-ring protein FliF  25.32 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  26.27 
 
 		 524 aa  97.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  25 
 
 		 527 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  22.87 
 
 		 530 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  24.11 
 
 		 513 aa  92  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1111  flagellar MS-ring protein  23.66 
 
 		 527 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.330038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  23.9 
 
 		 537 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  28.36 
 
 		 518 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  25.5 
 
 		 512 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  26.51 
 
 		 535 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  23.59 
 
 		 528 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  22.9 
 
 		 533 aa  87.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  23.53 
 
 		 529 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0476  flagellar M-ring protein FliF  28.98 
 
 		 489 aa  86.7  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.218102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  23.6 
 
 		 527 aa  84  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  29.75 
 
 		 536 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0631  flagellar MS-ring protein  25.12 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  26.15 
 
 		 590 aa  82  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  24.46 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  24.1 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2003  flagellar MS-ring protein  23.98 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0234  flagellar MS-ring protein  25.43 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.151863  normal  0.235707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0711  flagellar MS-ring protein  25.43 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.633063  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1645  flagellar MS-ring protein  22.74 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.01251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  23.75 
 
 		 521 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  27.2 
 
 		 498 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1389  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  27.55 
 
 		 548 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  25.38 
 
 		 538 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2287  flagellar M-ring protein FliF  26.91 
 
 		 539 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.890637 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  23.67 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  23.66 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  23.67 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  23.67 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0297  flagellar MS-ring protein  23.01 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  22.65 
 
 		 593 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  25.32 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  23.67 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  23.37 
 
 		 552 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0363  flagellar MS-ring protein  22.4 
 
 		 560 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5059  flagellar MS-ring protein  24.18 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48638  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  26.9 
 
 		 568 aa  75.5  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  24.13 
 
 		 580 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0340  flagellar MS-ring protein  22.4 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0171  flagellar MS-ring protein  24.12 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  23.37 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  28.4 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  25.2 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2991  flagellar M-ring protein FliF  30.18 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  25.2 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  23.08 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  25.2 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  23.08 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4655  flagellar MS-ring protein  24.53 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702143  normal  0.459158 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  28.4 
 
 		 597 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  24.91 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1591  flagellar MS-ring protein  22.78 
 
 		 565 aa  73.6  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  25.85 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  23.03 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  25.71 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  25.24 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  25.24 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  25.24 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  30.23 
 
 		 586 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  25.85 
 
 		 584 aa  72  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  25.93 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  24.57 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  24.57 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  24.57 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  24.57 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  26.18 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  24.57 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  22.72 
 
 		 600 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2271  flagellar M-ring protein FliF  24.41 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  23.65 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2936  flagellar M-ring protein FliF  24.51 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  23.19 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  22.2 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  22.91 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  27.14 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  25.32 
 
 		 587 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4180  flagellar MS-ring protein  25.6 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>