264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2003 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2003  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
528 aa  1077    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1111  flagellar MS-ring protein  76.89 
 
 
527 aa  798    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.330038  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1693  flagellar M-ring protein FliF  30.08 
 
 
503 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1391  flagellar M-ring protein FliF  27.68 
 
 
519 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.716479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  26.74 
 
 
519 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  35.7 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  29.98 
 
 
521 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  26.82 
 
 
527 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0688  flagellar MS-ring protein  29.03 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  27.15 
 
 
500 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0410  flagellar M-ring protein FliF  26.22 
 
 
527 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  26.71 
 
 
531 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1337  flagellar M-ring protein FliF  28.34 
 
 
524 aa  159  9e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.435471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  26.2 
 
 
525 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0545  flagellar MS-ring protein  28.38 
 
 
551 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0841  flagellar M-ring protein FliF  27.16 
 
 
533 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  26.51 
 
 
530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0849  flagellar M-ring protein FliF  29.57 
 
 
540 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4150  flagellar M-ring protein FliF  25.22 
 
 
537 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3922  flagellar M-ring protein FliF  25.71 
 
 
522 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0548473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3426  flagellar M-ring protein FliF  26.37 
 
 
528 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  27.29 
 
 
561 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  25.94 
 
 
593 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  28 
 
 
552 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2027  flagellar M-ring protein FliF  28.37 
 
 
534 aa  150  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.506682 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1389  flagellar M-ring protein FliF  30.89 
 
 
507 aa  150  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0978  flagellar M-ring protein FliF  26.88 
 
 
527 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.102842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2347  flagellar M-ring protein FliF  30.11 
 
 
559 aa  150  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.473038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0269  flagellar M-ring protein FliF  29.72 
 
 
551 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  24.77 
 
 
523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  26.61 
 
 
568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  27.62 
 
 
580 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1113  flagellar M-ring protein FliF  27.72 
 
 
562 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.132645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1765  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 
518 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.604512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  28.17 
 
 
595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2173  flagellar M-ring protein FliF  26.18 
 
 
560 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  31.37 
 
 
563 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31220  flagellar basal-body M-ring protein/flagellar hook-basal body protein FliF  27.22 
 
 
530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0799735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1192  flagellar M-ring protein FliF  29.53 
 
 
519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  28.94 
 
 
603 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.12 
 
 
677 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  28.69 
 
 
600 aa  140  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  25.99 
 
 
548 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2044  flagellar MS-ring protein  31.57 
 
 
498 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  25.87 
 
 
537 aa  139  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  30.24 
 
 
598 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  30.24 
 
 
598 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  27.11 
 
 
567 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1642  flagellar M-ring protein FliF  33.09 
 
 
536 aa  138  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0112721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.24 
 
 
598 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  30.63 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.68 
 
 
587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  25.11 
 
 
560 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0599  flagellar MS-ring protein  27.19 
 
 
541 aa  137  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  27.66 
 
 
546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0703  flagellar M-ring protein FliF  27.03 
 
 
532 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.408742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3029  flagellar M-ring protein FliF  28.03 
 
 
537 aa  136  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  29.31 
 
 
587 aa  136  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0727  flagellar M-ring protein FliF  27.98 
 
 
532 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.425125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  25.79 
 
 
588 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  26.75 
 
 
594 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 
598 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  26.09 
 
 
587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  26.93 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0424  flagellar M-ring protein FliF  28.07 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
579 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  28.79 
 
 
552 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  29.33 
 
 
590 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  28.79 
 
 
552 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  28.79 
 
 
552 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  28.79 
 
 
552 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  26.23 
 
 
552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 
587 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  27.17 
 
 
552 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0834  flagellar M-ring protein FliF  24.5 
 
 
535 aa  134  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000164203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  26.25 
 
 
566 aa  133  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6057  flagellar MS-ring protein  29.43 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0632593  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  30.91 
 
 
611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  30.91 
 
 
611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  28.68 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  28.4 
 
 
568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2668  flagellar M-ring protein FliF  28.12 
 
 
538 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.64 
 
 
611 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  27.54 
 
 
566 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0472  flagellar MS-ring protein  28.69 
 
 
566 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2745  flagellar MS-ring protein  26.43 
 
 
543 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  29.79 
 
 
587 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  29.79 
 
 
587 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  29.79 
 
 
587 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0790  flagellar M-ring protein FliF  30 
 
 
533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0592385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 
570 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 
570 aa  130  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  29.82 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>