256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03162 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1717  flagellar MS-ring protein  82.18 
 
 		 580 aa  951    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.869782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  94.14 
 
 		 580 aa  1102    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 580 aa  1182    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  47.94 
 
 		 568 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02889  flagellar MS-ring protein  49.73 
 
 		 564 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1502  flagellar MS-ring protein  44.83 
 
 		 563 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  46.11 
 
 		 560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  46.11 
 
 		 560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  46.11 
 
 		 560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  45.94 
 
 		 560 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  45.22 
 
 		 560 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  45.58 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  45.58 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  46.11 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  45.74 
 
 		 568 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  46.94 
 
 		 553 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  45.89 
 
 		 558 aa  458  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  44.14 
 
 		 566 aa  451  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  47.5 
 
 		 565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  46.42 
 
 		 569 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  43.76 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  44.89 
 
 		 565 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  33.45 
 
 		 594 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  33.51 
 
 		 592 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  33.51 
 
 		 592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  32.78 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  34.84 
 
 		 568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  33.16 
 
 		 592 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  33.1 
 
 		 594 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  34.15 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  32.44 
 
 		 556 aa  277  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 544 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  34.2 
 
 		 552 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  30.24 
 
 		 544 aa  274  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 		 558 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  31.99 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32.33 
 
 		 597 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  33.28 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  33.15 
 
 		 567 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  31.89 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.24 
 
 		 595 aa  242  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 600 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  32.84 
 
 		 603 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  32.04 
 
 		 552 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 587 aa  234  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  32.06 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  30.6 
 
 		 590 aa  231  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.87 
 
 		 587 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  30.47 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  32.04 
 
 		 574 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  32.04 
 
 		 574 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  31.61 
 
 		 567 aa  223  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  29.33 
 
 		 566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  30.47 
 
 		 580 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.27 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.42 
 
 		 587 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  28.88 
 
 		 548 aa  220  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 598 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 598 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  33.91 
 
 		 594 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  30.64 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.45 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.51 
 
 		 677 aa  213  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  29.32 
 
 		 570 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  30.44 
 
 		 558 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.72 
 
 		 593 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  30.85 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  29.58 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  29.58 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  29.47 
 
 		 565 aa  203  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.38 
 
 		 571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  29.25 
 
 		 584 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  32.34 
 
 		 572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  28.75 
 
 		 611 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  29.23 
 
 		 576 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  29.8 
 
 		 569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  29.32 
 
 		 588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 		 582 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  27.83 
 
 		 583 aa  190  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  27.37 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.84 
 
 		 552 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 		 552 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 		 552 aa  187  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  31.29 
 
 		 568 aa  186  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 		 552 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.61 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1978  flagellar M-ring protein FliF  28.26 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  31.94 
 
 		 560 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0172  flagellar M-ring protein FliF  29.33 
 
 		 500 aa  183  9.000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0053  flagellar FliF M-ring protein  32.36 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.38 
 
 		 579 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  31.9 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  30.4 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  27.78 
 
 		 566 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>